報(bào)告題目：計(jì)算機(jī)藥物設(shè)計(jì)：算法研發(fā)邏輯與藥物研發(fā)邏輯的默契
報(bào)告人：鄭錚 教授
報(bào)告時(shí)間：2022年5月13日（星期五）14:30-16:00
報(bào)告地點(diǎn)：化學(xué)樓二樓一號(hào)會(huì)議室
報(bào)告摘要：
在計(jì)算機(jī)藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域的算法開(kāi)發(fā)及應(yīng)用中，藥物與靶點(diǎn)的結(jié)合強(qiáng)度、優(yōu)勢(shì)結(jié)合模式的穩(wěn)定性等熱力學(xué)主導(dǎo)的性質(zhì)、特征往往被認(rèn)為是苗頭化合物篩選及先導(dǎo)化合物優(yōu)化的重要標(biāo)準(zhǔn)。然而在分子層面的藥物活性預(yù)測(cè)中，除熱力學(xué)特征外，藥物與靶點(diǎn)的動(dòng)力學(xué)特征也至關(guān)重要。基于報(bào)告人團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的Consecutive Histograms Monte Carlo Method (CHMC)，是一種采用平行運(yùn)算方式來(lái)模擬PMF曲面的自由能采樣計(jì)算方法。該方法使得自由能運(yùn)算免受跨越勢(shì)能壘之苦，同時(shí)利用對(duì)連續(xù)空間的平行采樣運(yùn)算，大幅提升了運(yùn)算速度。可為藥物分子層面的設(shè)計(jì)工作在熱力學(xué)及動(dòng)力學(xué)方面提供高效的結(jié)構(gòu)及物化性質(zhì)分析以及相關(guān)的機(jī)理解釋。
報(bào)告人簡(jiǎn)介：
鄭錚，武漢理工大學(xué)化學(xué)化工與生命科學(xué)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師；美國(guó)QuantumBio公司科學(xué)顧問(wèn)。2018年全職回國(guó)前擔(dān)任美國(guó)QuantumBio公司資深科學(xué)家。美國(guó)佛羅里達(dá)大學(xué)化學(xué)博士，北京大學(xué)藥學(xué)學(xué)士。鄭錚博士長(zhǎng)年致力于計(jì)算化學(xué)、化學(xué)及生物信息學(xué)與機(jī)器學(xué)習(xí)等領(lǐng)域相關(guān)的算法研究與開(kāi)發(fā)。所主導(dǎo)開(kāi)發(fā)軟件產(chǎn)品Movable Type Package為包括美國(guó)德州大學(xué)MD Anderson癌癥中心、葛蘭素史克公司、DeepCure等多家研究機(jī)構(gòu)與企業(yè)廣泛使用。
